27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0087 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  100 
 
 		 334 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  76 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  65.18 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  65.29 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  64.65 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  62.58 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  61.49 
 
 		 329 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 415 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  32.74 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  25.56 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.13 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.03 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>