21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2775 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  65.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  65.11 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  58.46 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  57.45 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  58.36 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  57.23 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  34.58 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  26.45 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.97 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  22.83 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  32.38 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>