31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0887 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  100 
 
 		 327 aa  672    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  26.45 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  27.8 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  28 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  22.39 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.02 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  20.73 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  21.94 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  21.48 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  22.38 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>