32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1101 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  100 
 
 		 329 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  61.68 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  62.54 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  62.54 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  61.49 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  57.45 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  59.63 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  27.46 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  23.16 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.25 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  33.93 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 287 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  22.09 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  22.09 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>