178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3823 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  58.5 
 
 
297 aa  363  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  59.4 
 
 
298 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  59.4 
 
 
298 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  59.4 
 
 
298 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  58.5 
 
 
300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  57.29 
 
 
291 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  57.09 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  57.65 
 
 
293 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  48.46 
 
 
291 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  47.78 
 
 
287 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  49.32 
 
 
295 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  51.92 
 
 
289 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  51.36 
 
 
286 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  47.62 
 
 
288 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  46.42 
 
 
287 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  51.06 
 
 
289 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  50.53 
 
 
289 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  49.65 
 
 
289 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  50.18 
 
 
294 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  45.86 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  46.55 
 
 
294 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.29 
 
 
289 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
294 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.93 
 
 
293 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
265 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  30.12 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
278 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  35.05 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
276 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  34.86 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.98 
 
 
286 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
278 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
277 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
270 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.8 
 
 
283 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
286 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  30 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  29.54 
 
 
293 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  35.88 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  34.17 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.66 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
288 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.86 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  29.39 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  29.44 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  30.98 
 
 
884 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  25.07 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  28.83 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>