77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1504 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  100 
 
 		 340 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  98.82 
 
 		 340 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  75 
 
 		 340 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  67.89 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  67.68 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  65.55 
 
 		 341 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  59.29 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  58.31 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  57.06 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  60.44 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  60.67 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  56.56 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  51.64 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  51.34 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  52.63 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  47.83 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  37.73 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  36.5 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 358 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 508 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.51 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.07 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  23.24 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  21.74 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  21.59 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  21.1 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>