83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0729 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  100 
 
 
353 aa  724    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  78.19 
 
 
364 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  59.51 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  57.01 
 
 
341 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  57.76 
 
 
344 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  59.94 
 
 
346 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  54.6 
 
 
345 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  55.66 
 
 
340 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  51.64 
 
 
340 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  51.64 
 
 
340 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  55.59 
 
 
345 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
348 aa  359  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  52.17 
 
 
347 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  52.16 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  46.79 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  50.63 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  35.38 
 
 
334 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  34.15 
 
 
334 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  33.43 
 
 
333 aa  205  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  34.15 
 
 
334 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  26.73 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
508 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
498 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
308 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
291 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
304 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
288 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
279 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.43 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.46 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.69 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
287 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  21.97 
 
 
278 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
300 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
497 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  23.63 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.65 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.36 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
289 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.9 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  22.71 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
278 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  25 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  25 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
287 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.82 
 
 
278 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  22.02 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  28 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.05 
 
 
345 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
294 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
288 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>