27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0625 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  100 
 
 
491 aa  1021    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  50.9 
 
 
440 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  29.74 
 
 
497 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  31.45 
 
 
508 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
498 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
334 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
333 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
334 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
334 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
341 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  31.75 
 
 
345 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
338 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
340 aa  84  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
346 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  28.7 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  24 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
332 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>