72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1956 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  100 
 
 		 346 aa  710    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  70.23 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  75.45 
 
 		 345 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  65.32 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  65.77 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  65.05 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  62.17 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  61.85 
 
 		 345 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  63.94 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  63.04 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  59.94 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  61.83 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  59.02 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  60.67 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  60.67 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  50.66 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  35.56 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  35.26 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  34.62 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  35.35 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 491 aa  90.1  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.66 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.5 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 497 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  21.56 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  23.04 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28 
 
 		 279 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  28.57 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>