82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3997 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  100 
 
 		 308 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  80.94 
 
 		 318 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  78.67 
 
 		 300 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  79.26 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  76 
 
 		 300 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  75.33 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  71.9 
 
 		 310 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  70.32 
 
 		 308 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  69.64 
 
 		 301 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  69.87 
 
 		 301 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  68.3 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  69.21 
 
 		 301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  33.13 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  23.26 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  24.66 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  23.11 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  26.87 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.32 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  23.63 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.32 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  21.66 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  22.79 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24.31 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  21.86 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.86 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  22.92 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 364 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 345 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>