63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0337 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  100 
 
 
288 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  59.43 
 
 
311 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  53.82 
 
 
324 aa  330  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
255 aa  92  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  29.61 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  24.52 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.82 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
364 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  21.58 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.66 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.35 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
381 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  20.97 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.55 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24.86 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  23.3 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
243 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
355 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  21.94 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
300 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  29.2 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  21.3 
 
 
278 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  23.63 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  21.01 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.15 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  21.89 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  20.74 
 
 
345 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
378 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>