16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4473 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  20.83 
 
 
282 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
305 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
358 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.79 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
364 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.57 
 
 
358 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>