80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1795 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  37.89 
 
 
292 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  29.14 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  29.27 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  30.27 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.94 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  21.61 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  26.51 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  20.19 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
218 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
279 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
246 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  30.27 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  23.76 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
381 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  33.08 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  33.03 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.48 
 
 
339 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  21.15 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.81 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
339 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
294 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
266 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
326 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.16 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
288 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  21.6 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.76 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.12 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  20.89 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  25 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
268 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
331 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>