107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7141 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  100 
 
 
308 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  96.35 
 
 
301 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  95.02 
 
 
301 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  89.4 
 
 
304 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  89.37 
 
 
301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  86.36 
 
 
310 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  70.32 
 
 
308 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  69.23 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  67.67 
 
 
300 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  67 
 
 
300 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  66 
 
 
300 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  65.89 
 
 
309 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  31.74 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  32.56 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.5 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
346 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.35 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.33 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.81 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.01 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
300 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  25.52 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  32.14 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24 
 
 
266 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
311 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
298 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
387 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  25.45 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  25.36 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  30.38 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  23.29 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.95 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  22.74 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  22.54 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  24.24 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  22.17 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>