77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2796 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  98.82 
 
 		 340 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  75.29 
 
 		 340 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  68.2 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  67.68 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  65.55 
 
 		 341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  59.29 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  58.31 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  57.06 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  60.44 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  60.67 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  56.56 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  51.64 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  51.64 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  52.63 
 
 		 309 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  47.83 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  37.73 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  36.5 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  33.64 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  29.36 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.76 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 498 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 508 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  24 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 293 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.12 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.44 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  23.24 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 287 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  21.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 280 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.83 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  21.1 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  20.61 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>