67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3496 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  100 
 
 		 336 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  77.31 
 
 		 347 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  72.26 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  72.51 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  63.39 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  65.49 
 
 		 345 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  65.05 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  60.94 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  58.75 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  56.88 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  56.56 
 
 		 340 aa  384  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  56.56 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  56.56 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  52.16 
 
 		 353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  52.8 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  50.66 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  29.22 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  30.83 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  31.16 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.65 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  25 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  20.28 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.76 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  20.55 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>