87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2657 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  100 
 
 
333 aa  686    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  72.95 
 
 
334 aa  524  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  72.04 
 
 
334 aa  521  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  72.56 
 
 
334 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
341 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
340 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
338 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
340 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  33.43 
 
 
353 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  33.64 
 
 
340 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  34.14 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
364 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
344 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  34.13 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  35.35 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  30.75 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  31.68 
 
 
336 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  29.87 
 
 
348 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  31.45 
 
 
345 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  29.69 
 
 
309 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
320 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  33 
 
 
332 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
491 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
440 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
498 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  27.65 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.74 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  22.52 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.54 
 
 
276 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.68 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.11 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.03 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.01 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
288 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  21.28 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.15 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  21.3 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  24.62 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
305 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
265 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  22.17 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  24.56 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>