53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2429 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  100 
 
 
320 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  51.76 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  50.65 
 
 
344 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  48.4 
 
 
338 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  51.32 
 
 
347 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  50.8 
 
 
364 aa  308  9e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  51.51 
 
 
340 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  50.66 
 
 
336 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  47.83 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  47 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  47.96 
 
 
345 aa  291  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  48.16 
 
 
340 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  48.16 
 
 
340 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  47.14 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  50.66 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  47.12 
 
 
309 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  33.86 
 
 
334 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  32.92 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  33.23 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
333 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
358 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
332 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
508 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
497 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.84 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.84 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.03 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
286 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  23.18 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  21.99 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
286 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.62 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  19.48 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  20.96 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>