167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4901 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  75.26 
 
 
299 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  62.72 
 
 
287 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  62.72 
 
 
291 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  61.54 
 
 
291 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  63.83 
 
 
295 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  66.08 
 
 
289 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  62.02 
 
 
288 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  62.94 
 
 
294 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  63.6 
 
 
289 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  58.89 
 
 
287 aa  360  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  62.19 
 
 
289 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  62.02 
 
 
289 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  58.19 
 
 
297 aa  351  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  63.76 
 
 
286 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  57.65 
 
 
297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  57.59 
 
 
294 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  54.67 
 
 
290 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  51.21 
 
 
300 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  50.88 
 
 
298 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  51.43 
 
 
298 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  51.43 
 
 
298 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  41.92 
 
 
289 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  41.07 
 
 
293 aa  218  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
294 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.58 
 
 
276 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  32.58 
 
 
276 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
312 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  32.53 
 
 
286 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.42 
 
 
293 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
270 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  33.76 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  32.58 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
305 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
277 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
286 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
278 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  30.08 
 
 
283 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  32.91 
 
 
282 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
286 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
279 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
279 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  31.34 
 
 
278 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.32 
 
 
293 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.93 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.51 
 
 
294 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
287 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.82 
 
 
287 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
313 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.68 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  31.94 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  29.01 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.94 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.44 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  26.22 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.94 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  27.9 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  26.61 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  24.88 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25.33 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.9 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
358 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>