105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  81.21 
 
 
283 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  69.04 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  49.82 
 
 
285 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  49.11 
 
 
291 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  48.94 
 
 
285 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
279 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  35.04 
 
 
277 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  32.28 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  28.42 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
276 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
278 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
287 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  35.05 
 
 
287 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  33.02 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.4 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.22 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.22 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.76 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  30.05 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.93 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.59 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.26 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  28 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.73 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.61 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
884 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  23.69 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.22 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  24 
 
 
331 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.02 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  21.85 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  27.8 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26 
 
 
358 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
267 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
313 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.8 
 
 
385 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.5 
 
 
341 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  21.03 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.5 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.22 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>