105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3852 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  59.79 
 
 
283 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  59.07 
 
 
287 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  59.07 
 
 
287 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  58.72 
 
 
287 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
278 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  33.57 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
312 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
278 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  33.05 
 
 
307 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
276 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
277 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  36.94 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
286 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
279 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  36.7 
 
 
279 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
277 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
289 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  30.93 
 
 
291 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  33.86 
 
 
286 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
289 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
288 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
293 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
289 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
289 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  33.49 
 
 
278 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
289 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
287 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
279 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.14 
 
 
287 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
291 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
295 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
294 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  31.66 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
331 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.9 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  29.44 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.21 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  27.15 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.36 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  30.93 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  30.93 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
332 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.5 
 
 
341 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.5 
 
 
385 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  25.96 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.38 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
348 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.09 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  35.9 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  35.9 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.11 
 
 
339 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
342 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  31.07 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  29.13 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.13 
 
 
345 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  33.04 
 
 
397 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  32.1 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  38.1 
 
 
337 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  31.82 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>