98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0928 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  50.52 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  50.53 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  49.82 
 
 		 283 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  50.53 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  49.29 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  51.43 
 
 		 281 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  32.07 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  36.25 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  31.71 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  29.83 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  30.74 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.69 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.32 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.26 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.52 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  31.02 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  29.32 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.17 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  22.79 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  25.12 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  21.71 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.34 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.66 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.99 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  22.39 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 358 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  20.24 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 333 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>