191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2836 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  100 
 
 
291 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  64.71 
 
 
297 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  66.9 
 
 
299 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  58.28 
 
 
300 aa  346  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  57.29 
 
 
297 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
298 aa  341  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
298 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
298 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  61.54 
 
 
293 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  56.64 
 
 
286 aa  319  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  52.43 
 
 
295 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  51.4 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  50.87 
 
 
287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  53.98 
 
 
289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  49.48 
 
 
291 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  55.83 
 
 
294 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  50.17 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  55.02 
 
 
289 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  54.17 
 
 
289 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  54.17 
 
 
289 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  51.68 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  49.48 
 
 
290 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.72 
 
 
289 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
293 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  40.23 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  33.48 
 
 
276 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
312 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
278 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  35.35 
 
 
279 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  35.07 
 
 
270 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  39.59 
 
 
286 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.86 
 
 
277 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  36.97 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.7 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.1 
 
 
278 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  33.18 
 
 
279 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  37.06 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  34.76 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  33.19 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
279 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
286 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
286 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  31.51 
 
 
307 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.96 
 
 
300 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
288 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  32.57 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  35.85 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  32.57 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.15 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  33.82 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  29.44 
 
 
279 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  25.82 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.1 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  30.88 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  30.59 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  31.02 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.79 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
218 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  25.55 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.63 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  26.95 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  27.06 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
353 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.46 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  27.81 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>