134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2868 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  100 
 
 
290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  59.38 
 
 
287 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  59.03 
 
 
287 aa  364  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  59.23 
 
 
295 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  58.68 
 
 
291 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  58.89 
 
 
288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  61.03 
 
 
294 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  58.89 
 
 
289 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
286 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  54.17 
 
 
299 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  49.48 
 
 
291 aa  299  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  54.33 
 
 
293 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  50.7 
 
 
294 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  51.6 
 
 
289 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  49.65 
 
 
289 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  50.18 
 
 
289 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  46.18 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  45.7 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  44.56 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  43.25 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  43.25 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  42.56 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  34.14 
 
 
293 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
269 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
294 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.48 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.68 
 
 
276 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
286 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.81 
 
 
278 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  33.67 
 
 
286 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.08 
 
 
277 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
293 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.19 
 
 
283 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  31.47 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.47 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.13 
 
 
307 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.35 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.35 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.19 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  30 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.28 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.57 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  28.85 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  25 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
332 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  20.28 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  24.63 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  21.3 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  24.1 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  21.3 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  25 
 
 
327 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.2 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
300 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>