163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1437 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  77.9 
 
 
276 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  72.1 
 
 
276 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  68.84 
 
 
278 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  53.43 
 
 
312 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
278 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.12 
 
 
277 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
283 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
279 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
285 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.52 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  33.47 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  33.2 
 
 
278 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.37 
 
 
279 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.93 
 
 
283 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  31.86 
 
 
291 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  30.9 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
294 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  31.28 
 
 
289 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  30.24 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.49 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
289 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  29.65 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.9 
 
 
289 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.9 
 
 
287 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
297 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
283 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  30.4 
 
 
294 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
287 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
287 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
286 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
287 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
298 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
298 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
298 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
279 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
293 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  29.06 
 
 
281 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
287 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
290 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
293 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
295 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  31.66 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.8 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.7 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
305 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.11 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  31.47 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
331 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.76 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
279 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
303 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.06 
 
 
282 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  30.7 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  31.76 
 
 
358 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
381 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
338 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.48 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  20.9 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
338 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>