171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2750 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  100 
 
 		 387 aa  775    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  75.59 
 
 		 381 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  38.64 
 
 		 290 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  37.67 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  36.24 
 
 		 283 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  40 
 
 		 280 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  38.24 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  29.94 
 
 		 280 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  29.74 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  29.92 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.6 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.19 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.6 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  21.37 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.09 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  31.84 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  26.07 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.34 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.86 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.94 
 
 		 262 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.53 
 
 		 341 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 246 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 289 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 267 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 294 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.78 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.28 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 279 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  21.67 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  27.03 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.09 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.77 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.35 
 
 		 629 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.42 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.45 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.76 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>