88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1776 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  98.56 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  90.94 
 
 		 279 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  89.96 
 
 		 279 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  35.27 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  36.16 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  36.08 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  37.56 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  32.58 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.5 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.17 
 
 		 286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  30.81 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.58 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  34.67 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  31.01 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.33 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.83 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.92 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  37.65 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  30.67 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  34.76 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.27 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  34.76 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  32.45 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  31.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.91 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  22.54 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  23.55 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  25 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.27 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>