186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2759 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  65.11 
 
 
312 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  53.24 
 
 
278 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  53.43 
 
 
276 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  53.07 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
277 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
283 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
277 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
287 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  33.2 
 
 
291 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  32.07 
 
 
285 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.03 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  33.22 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  31.06 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.42 
 
 
279 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
293 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
289 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.7 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
270 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
289 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.89 
 
 
287 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.69 
 
 
283 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
287 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.28 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
286 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
297 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  31.14 
 
 
289 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
289 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.58 
 
 
300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
291 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
297 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  30.26 
 
 
294 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
279 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  34.1 
 
 
283 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
294 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.74 
 
 
287 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
289 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  30.81 
 
 
290 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.65 
 
 
293 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
303 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
288 aa  92  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.94 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  30.62 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  21.62 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  21.16 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  21.4 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.44 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
395 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
353 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
245 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.4 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>