90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4348 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  94.98 
 
 
279 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  90.94 
 
 
277 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  90.94 
 
 
277 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  90.94 
 
 
277 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
288 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  33.93 
 
 
288 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
279 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  36.08 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.54 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  30.46 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.47 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
299 aa  88.6  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
278 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.78 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
289 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.58 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  36.25 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  36.25 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  36.42 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  32.89 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  30 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  34.01 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.51 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.9 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  23.7 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.64 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.64 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  23.02 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.29 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
291 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.43 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  27.39 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.18 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
358 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>