179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0606 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  100 
 
 		 291 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  90.59 
 
 		 287 aa  557  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  87.63 
 
 		 295 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  89.86 
 
 		 288 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  78.75 
 
 		 287 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  71.68 
 
 		 289 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  66.89 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  59.93 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  60.84 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  62.72 
 
 		 293 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  58.68 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  58.25 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  57.19 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  57.54 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  56.64 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  49.48 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  49.14 
 
 		 297 aa  298  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  48.46 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  44.07 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  43.64 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  43.64 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  43.45 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  37.89 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  40.29 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.68 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  34.39 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  35 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  33.8 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  34.5 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  26.72 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.13 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  30.73 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.36 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  29.48 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.9 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.63 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.96 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.48 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  29.22 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  27 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  29.41 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  26.73 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  26.39 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.35 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.92 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  21.8 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.43 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>