125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1842 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  49.1 
 
 
279 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  44.4 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  37.97 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  37.02 
 
 
285 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
312 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
291 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  36.93 
 
 
281 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  35.52 
 
 
283 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.98 
 
 
276 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
278 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
277 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
276 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.72 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.36 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
283 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  33.48 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  32.29 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  31.95 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
291 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
289 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.48 
 
 
286 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.82 
 
 
283 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  31.22 
 
 
294 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.06 
 
 
279 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
279 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
289 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
289 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
289 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  33 
 
 
297 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
287 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
287 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.71 
 
 
300 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
270 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.86 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.84 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  31.22 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  33.49 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.18 
 
 
287 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.91 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.05 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.54 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.89 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  27.09 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.9 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.47 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.37 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
313 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
271 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  27.27 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  36.47 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
349 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.77 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.48 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>