201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2147 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  100 
 
 		 286 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  73.65 
 
 		 282 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  72.79 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  34.25 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  37.55 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  40.55 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  39.59 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  35.68 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  35.35 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  34.88 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  35.55 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  33.8 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  36.82 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  33.02 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  33.05 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  33.05 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  30.98 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  33.05 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  35.68 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.53 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  37.02 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  33.86 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  32.56 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  31.2 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  33.01 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  29.47 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.38 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  37.65 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  37.65 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.34 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  36.42 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  36.02 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  28.37 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.69 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.29 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  30.89 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.38 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  22.47 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.22 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  29.89 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  29 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  23.4 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.85 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>