131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0179 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  100 
 
 
294 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  40.23 
 
 
291 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  39.73 
 
 
300 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
297 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  42.31 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  42.31 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  42.31 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  39.51 
 
 
297 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  34.39 
 
 
291 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  36.2 
 
 
289 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  34.52 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  35 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
293 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
295 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  40.38 
 
 
299 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  35 
 
 
289 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
290 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  35.62 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  32.31 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
293 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  36.82 
 
 
289 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  35.98 
 
 
286 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  34.52 
 
 
294 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  35.83 
 
 
294 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  34.26 
 
 
286 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  29.68 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  30.47 
 
 
269 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
312 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
277 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.55 
 
 
286 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  35.51 
 
 
278 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.1 
 
 
270 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
305 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.33 
 
 
283 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
279 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  28.46 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.04 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.36 
 
 
307 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  34.34 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  28.86 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.25 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.65 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.75 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  24 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  20.31 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  20.7 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  24.56 
 
 
381 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
313 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
387 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  19.03 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>