173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1655 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  88.42 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  87.72 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  87.72 
 
 		 289 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  63.07 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  62.94 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  56.64 
 
 		 291 aa  348  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  55.94 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  55.44 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  56.69 
 
 		 288 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  60.21 
 
 		 294 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  58.74 
 
 		 289 aa  333  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  55.83 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  60.14 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  53 
 
 		 287 aa  324  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  54.23 
 
 		 297 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  50.7 
 
 		 290 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  50.53 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  49.48 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  49.65 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  49.65 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  49.65 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.37 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  39.07 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  36.82 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.86 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  32.86 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  35.55 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  37.81 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.7 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  33.62 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.62 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  33.95 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.52 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.65 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  24.38 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 277 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.03 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  28.37 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.01 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  26.79 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25.31 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.48 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  25.99 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.78 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.55 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>