179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4401 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  100 
 
 		 288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  88.85 
 
 		 295 aa  550  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  89.51 
 
 		 287 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  89.86 
 
 		 291 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  79.72 
 
 		 287 aa  484  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  72.73 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  68.73 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  62.85 
 
 		 286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  60.75 
 
 		 299 aa  346  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  58.33 
 
 		 289 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  58.48 
 
 		 289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  57.99 
 
 		 289 aa  334  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  58.89 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  62.77 
 
 		 293 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  56.69 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  51.4 
 
 		 291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  48.97 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  47.62 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  43.84 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  43.84 
 
 		 298 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  43.84 
 
 		 298 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.72 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  39.43 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  35 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  35.35 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  36.49 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  36.68 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  36.18 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  31.05 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  25.54 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.27 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.44 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  34.64 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.43 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  32 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  29.03 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  30.59 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  26.98 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  27.54 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  27 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  27 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  27 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.35 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>