174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1435 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  97.16 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  72.79 
 
 		 286 aa  431  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  40.29 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  34.02 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  41.74 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  34.2 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  36.68 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  36.68 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  37.81 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  36 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  35 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  36.32 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  34.86 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  33.61 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  33.64 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  37.19 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.48 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  35.81 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  31.3 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  31.47 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  30.12 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.75 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 283 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.65 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.54 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.06 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.98 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  30.09 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.49 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  36.25 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.06 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  34.76 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  34.76 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  34.71 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  28.71 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  23.51 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.52 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  24 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.33 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  31.02 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  32.8 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.38 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  28.32 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>