176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0495 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  86.59 
 
 		 276 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  73.19 
 
 		 276 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  68.84 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  56.88 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  53.24 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  34.98 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  32.3 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  33.87 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  33.9 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  34.82 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.25 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.57 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  28.87 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  33.07 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  31.88 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  31.6 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.71 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  32 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 331 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  31.34 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.11 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.65 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  32.9 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.75 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  20.95 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25.91 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>