211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3097 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  100 
 
 		 279 aa  563  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  66.29 
 
 		 270 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  63.33 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  58.24 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  34.87 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  38.56 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  32.92 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  35.75 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  35.35 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  33.46 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  36.08 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  33.07 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  35.53 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.51 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.55 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  32.98 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  33.49 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  33.49 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  32.85 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  32.71 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.3 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.08 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.02 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.86 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  25.82 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.6 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.96 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.53 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.1 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.1 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  31.29 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>