42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2842 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  100 
 
 
338 aa  681    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  62.06 
 
 
373 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0356  amidohydrolase 2  30.03 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0473488  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1129  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.44 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
380 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
275 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.3 
 
 
282 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.16 
 
 
283 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.06 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.45 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
278 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  30 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
278 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 
363 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  20 
 
 
312 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.69 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
290 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  29.94 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  30.89 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
380 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
280 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
286 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
276 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>