16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 363 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  56.86 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  55.69 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  41.5 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  46.43 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  36.64 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  36.18 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1463  amidohydrolase 2  41.02 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  28.96 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>