21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1629 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  100 
 
 		 351 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  78.12 
 
 		 340 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  77.51 
 
 		 335 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  79.11 
 
 		 337 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  77.13 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  73.54 
 
 		 344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  71.3 
 
 		 344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  73.46 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  27.16 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.37 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>