17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3747 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  91.02 
 
 		 335 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  100 
 
 		 334 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  91.87 
 
 		 340 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  87.72 
 
 		 337 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  77.13 
 
 		 351 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  75.3 
 
 		 344 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  75.9 
 
 		 344 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  71.17 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  27.53 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>