13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3327 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  100 
 
 
365 aa  766    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  54.99 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  31.45 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  31.45 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  32.5 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  31.68 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  32.46 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  31.58 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  31.17 
 
 
284 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
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