17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3499 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  89.22 
 
 		 335 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  100 
 
 		 337 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  87.8 
 
 		 340 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  87.72 
 
 		 334 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  77.44 
 
 		 351 aa  547  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  76.36 
 
 		 344 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  76.13 
 
 		 344 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  71.04 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 390 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  34.59 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  29.32 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  28.65 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>