19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1692 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  97.31 
 
 		 335 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  91.87 
 
 		 334 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  100 
 
 		 340 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  87.8 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  78.12 
 
 		 351 aa  554  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  74.92 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  74.55 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  72.92 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  29.82 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>