17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3843 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  100 
 
 
390 aa  809    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
351 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
335 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
340 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
337 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  29.24 
 
 
344 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  31.64 
 
 
344 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  25.35 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
284 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
319 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>