21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0014 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  100 
 
 		 374 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  70.32 
 
 		 379 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  40.92 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  34.75 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.64 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  38.07 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1463  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  21.71 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0356  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0473488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  19.16 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  21.76 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>