17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2949 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  100 
 
 
379 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  70.32 
 
 
374 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  41.5 
 
 
380 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
380 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.18 
 
 
363 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  36.44 
 
 
387 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  31.66 
 
 
330 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1463  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
287 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
300 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  20.85 
 
 
285 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25 
 
 
286 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>