12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6547 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  100 
 
 
380 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  56.86 
 
 
363 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  55.18 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  51.33 
 
 
330 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  41.53 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
374 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
379 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1463  amidohydrolase 2  40.46 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
338 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>