12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3071 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  100 
 
 		 387 aa  750    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  55.69 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6547  amidohydrolase 2  55.18 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  49.39 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0658  amidohydrolase 2  42.25 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  36.44 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  38.07 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1463  amidohydrolase 2  42.53 
 
 		 343 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1458  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 289 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>